新技術(shù)使玉米基因編輯不再“大海撈針”

        《中國科學(xué)報(bào)》 2020-10-14 11:08:36

        本報(bào)訊(記者李晨通訊員王靜)日前,《自然—通訊》在線發(fā)表了山東農(nóng)業(yè)大學(xué)農(nóng)學(xué)院教授李平華等中外科學(xué)家合作研究成果。他們探索出高通量研究玉米轉(zhuǎn)錄因子調(diào)控位點(diǎn)的新技術(shù),利用大規(guī)模轉(zhuǎn)錄因子數(shù)據(jù)重新構(gòu)建了玉米葉片基因表達(dá)調(diào)控網(wǎng)絡(luò),使玉米基因編輯不再“大海撈針”。

        葉片是保證玉米產(chǎn)量的重要器官,研究玉米葉片表達(dá)相關(guān)轉(zhuǎn)錄因子,解析其調(diào)控機(jī)制和網(wǎng)絡(luò),對玉米遺傳改良具有重要意義。轉(zhuǎn)錄因子在動(dòng)植物生長發(fā)育及其對外界環(huán)境的反應(yīng)中起著重要作用,是調(diào)控基因表達(dá)的最關(guān)鍵因子之一,也是生物學(xué)研究領(lǐng)域的焦點(diǎn)和熱點(diǎn)。真核細(xì)胞內(nèi)部的轉(zhuǎn)錄調(diào)控網(wǎng)絡(luò)由轉(zhuǎn)錄因子的組合作用所決定,但業(yè)內(nèi)對植物中轉(zhuǎn)錄因子的結(jié)合研究較少,對這種復(fù)雜的網(wǎng)絡(luò)仍知之甚少。

        該研究成果首次在玉米中全面解析了葉片表達(dá)轉(zhuǎn)錄因子的結(jié)合位點(diǎn),構(gòu)建了玉米葉片轉(zhuǎn)錄調(diào)控網(wǎng)絡(luò),分析了轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(diǎn)對葉片形態(tài)、吐絲開花等農(nóng)藝性狀的影響,解析了其在物種進(jìn)化中的保守性和變化,提出了轉(zhuǎn)錄因子共結(jié)合是影響植物轉(zhuǎn)錄調(diào)控特異性的關(guān)鍵因素的新觀點(diǎn)。

        該研究推動(dòng)了植物界對植物基因轉(zhuǎn)錄起始調(diào)控的認(rèn)識,使得遺傳及育種專家可以有目的地對基因調(diào)控位點(diǎn)進(jìn)行改造,編輯和創(chuàng)制新的基因調(diào)控位點(diǎn),訓(xùn)練機(jī)器學(xué)習(xí)模型來預(yù)測轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合和共定位,建立智能組合優(yōu)良等位基因,豐富基因多樣性。

        同時(shí),該成果為世界玉米基礎(chǔ)研究提供了第一手資料,也為玉米種質(zhì)資源創(chuàng)新提供了新思路和新方法,有利于實(shí)現(xiàn)智能、高效、定向培育新品種,促進(jìn)作物育種學(xué)科向更高層面發(fā)展。

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