堿基反向互補在線_反向互補 反向 互補序列有何區別

        互聯網 2023-05-04 15:45:59


        (資料圖片僅供參考)

        1、一、順序不同:原序列:AATTCCGG,則反向序列為:GGCCTTAA 就是原序列反過來;互補序列:TTAAGGCC 就是與原序列互補;反向互補:CCGGAATT 就是與反向序列互補。

        2、二、概念不同:互補的概念就是A-T,C--G配對要將核苷酸序列轉換成反向互補序列,需要用DNASTAR軟件,其中有EditSeq組件。

        3、三、序列編碼不同:在用DNAMAN的多序列比對時,包括編碼鏈和非編碼連的比對,測序得到的目的片段可能是非編碼鏈(即目的基因的編碼鏈的互補序列),而NCBI中提交的序列都是編碼鏈的序列。

        4、#!usr/bin/perl/-wprint "put in";$a=;chomp($a);@q=split (//,$a);@p=reverse @q;foreach my $i (@p){if ($i eq "A"){print "T";}elsif ($i eq "T"){print "A";}elsif ($i eq "G"){print "C";}elsif ($i eq "C"){print "G";}}擴展資料:利用反向PCR可對未知序列擴增后進行分析,探索鄰接已知DNA片段的序列,并可將僅知部分序列的全長cDNA進行分子克隆,建立全長的DNA探針。

        5、適用于基因游走、轉位因子和已知序列DNA旁側病毒整合位點分析等研究。

        6、用傳統的緩沖液和其他提供者推薦的條件裂解DNA。

        7、反向PCR所擴增的片段的大小由PCR擴增片段的大小決定,PCR擴增的實際上限為3-4kb。

        8、能裂解核心區的內切酶使反向PCR只能擴增引物所定模板(依賴于引物)的上游 或上游區,而不裂解核心區的酶則使兩上邊側序列都擴增,并帶有由內切酶和環化類 型決定的接點(例如,互補突頭連接與鈍頭連接)。

        9、參考資料來源:百度百科-反向PCR。

        本文分享完畢,希望對大家有所幫助。

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