近日,美國華盛頓州立大學(xué)領(lǐng)導(dǎo)的一項(xiàng)研究發(fā)現(xiàn),目前對動物基因組進(jìn)行的測序多數(shù)集中在與人類相似的動物上。研究人員警告稱,這會使人們忽視生物多樣性和錯失機(jī)會。相關(guān)成果發(fā)表于美國《國家科學(xué)院院刊》。
研究人員分析發(fā)現(xiàn),近3300種動物的基因組已被測序。然而,與世界上166萬種動物物種相比,這一數(shù)字還是很少,脊椎動物在目前的序列中占了絕大部分。數(shù)據(jù)顯示,盡管脊椎動物只代表了3.9%的動物物種,但卻占測序數(shù)據(jù)集的54%。相比之下,代表78.5%物種的節(jié)肢動物門無脊椎動物,只占當(dāng)前數(shù)據(jù)集的34%。
“隨著基因組數(shù)據(jù)集的迅速積累,我們會發(fā)現(xiàn),目前數(shù)據(jù)集并不是均勻分布在動物生命樹中?!毖芯孔髡?、華盛頓州立大學(xué)博士后研究員Scott Hotaling認(rèn)為,無脊椎動物仍然非常缺乏相關(guān)研究,因?yàn)槿藗兯坪醺P(guān)心脊椎動物。
研究通訊作者、美國楊百翰大學(xué)助理教授Paul Frandsen表示,要了解整個生態(tài)系統(tǒng),必須對更多的生物進(jìn)行采樣。脊椎動物是生態(tài)系統(tǒng)的重要組成部分,但昆蟲和許多其他小型生物可能發(fā)揮著更重要的作用,因?yàn)樗鼈兲幱谑澄镦湹牡锥恕?/p>
研究作者、華盛頓州立大學(xué)副教授Joanna Kelley還指出,目前絕大多數(shù)基因測序工作在發(fā)達(dá)國家開展,且大多數(shù)國家位于北半球,不同地區(qū)的測序工作也有特定的傾向。例如,北美國家對哺乳動物和昆蟲進(jìn)行了較多測序,歐洲國家、亞洲國家分別對魚類和鳥類進(jìn)行了較多測序。
近年來,幾項(xiàng)大型的基因組測序工作啟動,其中包括地球生物基因組計劃。該計劃設(shè)定了一個雄心勃勃的目標(biāo),在未來10年內(nèi)對所有真核生物進(jìn)行測序。
截至2021年6月,該計劃已收集到3300多個動物基因組數(shù)據(jù)集。研究人員通過計算發(fā)現(xiàn),以目前每天大約測序4個基因組的速度,要到3130年才能實(shí)現(xiàn)對所有真核生物進(jìn)行測序的目標(biāo)。
研究人員同時提出,促進(jìn)該目標(biāo)實(shí)現(xiàn)的一個方法是發(fā)展基礎(chǔ)設(shè)施,并讓更多來自南半球的國家,尤其是動物多樣性豐富的熱帶地區(qū)的研究人員參與其中。(辛雨)
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https://doi.org/10.1073/pnas.2109019118
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