【資料圖】
美國(guó)西達(dá)賽奈醫(yī)學(xué)中心研究人員創(chuàng)建了一種極為逼真且詳細(xì)的腦細(xì)胞計(jì)算機(jī)模型,將來(lái)自不同類(lèi)型實(shí)驗(yàn)室的數(shù)據(jù)集結(jié)合在一起,呈現(xiàn)了單個(gè)神經(jīng)元的電、遺傳和生物活動(dòng)的完整圖景。相關(guān)論文發(fā)表在9日的同行評(píng)議期刊《細(xì)胞報(bào)告》上,有助于回答有關(guān)神經(jīng)疾病甚至人類(lèi)智力方面的問(wèn)題,而這些問(wèn)題很難通過(guò)生物實(shí)驗(yàn)來(lái)獲得答案。
“這些模型捕捉了神經(jīng)元為了相互交流而發(fā)出的電信號(hào)的形狀、時(shí)間和速度,這被認(rèn)為是大腦功能的基礎(chǔ),讓我們可以在單細(xì)胞水平上復(fù)制大腦活動(dòng)。”論文資深作者、西達(dá)賽奈醫(yī)學(xué)中心神經(jīng)外科研究科學(xué)家科斯塔斯·阿納斯塔西烏博士說(shuō),這些模型可用來(lái)測(cè)試需要數(shù)十個(gè)實(shí)驗(yàn)才能檢驗(yàn)的理論。“假如你想研究50種不同的基因如何影響細(xì)胞的生物學(xué)過(guò)程,你需要?jiǎng)?chuàng)建一個(gè)個(gè)單獨(dú)的實(shí)驗(yàn)來(lái)‘敲除’每一個(gè)基因,看看會(huì)發(fā)生什么。有了我們的計(jì)算模型,就能夠更改目標(biāo)基因標(biāo)記的參數(shù),并加以預(yù)測(cè)?!?/p>
這些模型的另一個(gè)優(yōu)點(diǎn)是,它能讓研究人員完全控制實(shí)驗(yàn)條件。這為確定一個(gè)參數(shù),如神經(jīng)元表達(dá)的蛋白質(zhì),導(dǎo)致細(xì)胞變化或癲癇發(fā)作等疾病狀況提供了可能。而在實(shí)驗(yàn)室里,研究人員通??梢宰C明兩者之間的聯(lián)系,但很難證明原因。
阿納斯塔西烏表示,在實(shí)驗(yàn)室實(shí)驗(yàn)中,研究人員并不能控制一切。在新模型中,可改變一個(gè)參數(shù),并觀察它如何影響另一個(gè)參數(shù),這在生物實(shí)驗(yàn)中是很難做到的。
為了創(chuàng)建他們的模型,研究人員使用了來(lái)自小鼠初級(jí)視覺(jué)皮質(zhì)(大腦中處理來(lái)自眼睛信息的區(qū)域)的兩組不同的數(shù)據(jù)。
第一個(gè)數(shù)據(jù)集展示了數(shù)萬(wàn)個(gè)單細(xì)胞的完整基因圖片。第二個(gè)將來(lái)自同一腦區(qū)的230個(gè)細(xì)胞的電反應(yīng)和物理特征聯(lián)系在一起。研究人員使用機(jī)器學(xué)習(xí)來(lái)整合這兩個(gè)數(shù)據(jù)集,創(chuàng)建了9200個(gè)神經(jīng)元及其電活動(dòng)的生物逼真模型。
研究人員表示,這一模型代表著高性能計(jì)算的重大進(jìn)步,使科研人員能夠搜索細(xì)胞內(nèi)部和之間的關(guān)系,對(duì)大腦中不同細(xì)胞類(lèi)型的功能有更深入的了解。
下一步,團(tuán)隊(duì)將致力于創(chuàng)建人類(lèi)腦細(xì)胞的計(jì)算模型,以研究相關(guān)功能和疾病,幫助人們了解人腦最深處的奧秘。
(實(shí)習(xí)記者張佳欣)
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