暹羅斗魚是風靡全球的一種小型觀賞魚，最早在1000年前左右被人類馴化。長期以來，暹羅斗魚都因其多種多樣的體色、體型而備受人們的關注。
南昌大學生命科學學院洪一江教授團隊主要圍繞暹羅斗魚展開研究，開展群體遺傳學與全基因組關聯分析，很大程度上闡明了暹羅斗魚復雜的馴化歷史和表型多樣性的遺傳基礎。
近日，相關研究論文發表在刊物《科學進展》上。
(資料圖片)
構建高質量染色體水平基因組
作為一種小型觀賞魚，暹羅斗魚擁有眾多的表型性狀。何種類型的分子突變，作用在哪些基因上從而導致暹羅斗魚形成這些表型性狀？這一過程的分子調控機制是什么？
要研究決定暹羅斗魚表型的基因，首先必須要有高質量的參考基因組。研究團隊是如何對斗魚的基因進行測序的？
據悉，洪一江及其團隊采用了多種測序策略與輔助組裝工作，構建了暹羅斗魚高質量染色體水平基因組，最終組裝的基因組大小達451.29Mb。
在獲得暹羅斗魚高質量的參考基因組之后，團隊青年教師張萬昌與泰國研究人員合作，收集了700多條代表不同表型的個體，提取了每一條魚的DNA，并利用Illumina平臺開展重測序工作，獲得了每個個體的大量測序結果。
這些測序結果都被定位到了暹羅斗魚的參考基因組上，通過對700多個個體的測算，獲得了總共約2000萬個變異位點。
為篩選相關靶點藥物提供良好研究模型
“我們對暹羅斗魚的研究為進一步挖掘相關功能基因提供了天然的研究模型，在遺傳學、基因組學、發育生物學和神經生物學等學科領域均具有一定的價值。”洪一江表示，“暹羅斗魚經過歷史上多年以來的馴化和選育，已經形成了諸多種類的表型變異。”暹羅斗魚豐富而多樣的品種，為研究脊椎動物形態學發生提供了天然的研究材料。
暹羅斗魚基因組大小在各種常見物種中較小，約為斑馬魚的1/4、小鼠的1/7。暹羅斗魚較小的基因組，使得暹羅斗魚成為了一種較為理想的研究物種。相對于其他研究物種，其遺傳學研究和分子克隆的相關成本都比較低。
此外，暹羅斗魚最顯著的特征就是善于進行打斗。暹羅斗魚的打斗通常包含了前期恐嚇、相互接近、奮力搏斗和落敗一方逃離等具體過程。由于打斗的復雜性，對打斗這一行為的研究涉及遺傳學、神經生物學、內分泌學、組織生理學等多學科的許多復雜性狀。
“從我們的初步研究結果來看，在專門用于打斗的搏擊斗魚中，某些涉及神經系統調控的基因受到了強烈的選擇。”洪一江表示，“我們還發現，部分受選擇的基因在小鼠和人類研究中和精神疾病如精神分裂癥、雙向性格障礙、易怒等疾病密切相關。這為將來研究這些疾病，并進一步篩選相關靶點藥物提供了很好的研究模型。”（魏依晨）
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